近日，青海大學(xué)“青海省昆侖英才農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新團隊（青藏高原昆蟲生態(tài)與害蟲防治團隊）”來有鵬課題組，在Nature旗下期刊Scientific Data上發(fā)表了“Genome assembly of the grassland caterpillar  Gynaephora qinghaiensis ”一文。

草原毛蟲（Lepidoptera： Lymantriinae：Gynaephora）是一個小型昆蟲類群，全世界記錄有15個物種，分布在北極凍土帶和北半球的高海拔地區(qū)。在中國，所有8個被命名的Gynaephora物種都棲息在海拔2900至5000米的青藏高原地區(qū)。草原毛蟲是青藏高原高寒草甸最具破壞性的害蟲，它們不僅取食牧草，導(dǎo)致嚴重的飼草短缺和草地退化，還會引起家畜和野生動物的口腔黏膜潰瘍。

研究組就青海草原毛蟲（ Gynaephora qinghaiensis ）的基因組進行了組裝。組裝后的基因組大小為861.04 Mb，由107個contig組成，contig N50大小為18.65 Mb。BUSCO分析顯示，組裝體中含有99.56%（99.27%完整，0.29%片段化）的BUSCO基因。在 G. qinghaiensis 基因組中，預(yù)測有580.2 Mb（占基因組的67.4%）的重復(fù)序列和16 618個蛋白質(zhì)編碼基因。系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)分析表明， G. qinghaiensis 與銹色卷蛾 Orgyia antiqua 大約在1830萬年前分化。此外，基因家族進化分析表明，在 G. qinghaiensis 基因組中，有130個基因家族顯著擴張，43個基因家族收縮。參考基因組的可用性可為揭示草原毛蟲對高海拔環(huán)境的適應(yīng)性進化機制提供遺傳資源。同時，有助于制定草原毛蟲的綜合防控策略。該研究得到了青海省科技廳重點研發(fā)與轉(zhuǎn)化計劃專項（2023NK152）和青海省昆侖英才專項的支持。