農(nóng)科院標志

青海省農(nóng)林科學院成立于1951年，是廳級建制的省級農(nóng)林業(yè)科研機構，由省農(nóng)林廳代管。

2000年11月整建制劃歸青海大學，試行大學領導下的二級研究院管理體制，為副廳級建制，省教育廳主管，省科技廳、省農(nóng)業(yè)廳、省林業(yè)局協(xié)管。繼續(xù)保留青海省農(nóng)林科學院牌子，原機構設置保持不變，人員編制轉為大學科研事業(yè)編制，事業(yè)經(jīng)費預算由省財政核定基數(shù)戴帽下達。

2002年12月17日，青海省編制委員會下發(fā)《關于青海大學機構改革方案的批復》（青編委〔2002〕94號），青海省農(nóng)林科學院下設行政職能部門4個：辦公室、組織人事處、科研管理處、財務處；科研機構8個：作物育種栽培研究所（旱地農(nóng)業(yè)研究所）、園藝研究所、土壤肥料研究所、植物保護研究所、春油菜研究所、生物技術研究所、林業(yè)科學研究所、青藏高原野生植物資源研究所。重新核定定額補助事業(yè)編制291名，自收自支事業(yè)編制20名。

2018年2月14日，青海省機構編制委員會辦公室下發(fā)《關于確定青海大學農(nóng)林科學院 畜牧獸醫(yī)科學院事業(yè)單位類別的通知》（青編辦事發(fā)〔2018〕6號），確定農(nóng)林科學院為公益一類事業(yè)單位，同時將291名差額補貼事業(yè)編制調整為全額撥款事業(yè)編制。