近日,我院特色園藝研究團(tuán)隊(duì)一項(xiàng)菊苣肉質(zhì)根發(fā)育研究成果“Metabolic and transcriptional changes reveal molecular regulatory mechanism of taproot thickening development in root chicory (Cichorium intybus L.)”在Industrial Crops & Products(JCR分區(qū)Q1,影響因子6.449)上發(fā)表。
根用菊苣地下部分(肉質(zhì)根)是提取果聚糖的主要原料,但其膨大發(fā)育的生物學(xué)機(jī)制尚未得到解析。本研究圍繞肉質(zhì)根膨大發(fā)育過程中代謝物的變化,篩選出主要的差異表達(dá)基因(DEGs),繪制了重要結(jié)構(gòu)基因、代謝物和核心轉(zhuǎn)錄因子的網(wǎng)絡(luò)調(diào)控圖;分析篩選了核心轉(zhuǎn)錄因子基因,并對候選基因進(jìn)行qPCR差異表達(dá)驗(yàn)證。結(jié)果表明,膨大早期碳水化合物、脂類代謝物的豐度高于后期,而氨基酸類代謝物則相反;Ci-FEH2a、1-FFT、EXPA1、PER17、ERF13等基因參與了根用菊苣肉質(zhì)根膨大發(fā)育進(jìn)程;代謝產(chǎn)物和基因的差異表達(dá)在菊苣主根增厚中起著至關(guān)重要的作用。
本研究尚屬首次采用多組學(xué)方法來探究菊苣肉質(zhì)根膨大的生物學(xué)問題,著重探討了碳水化合物和轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控根莖營養(yǎng)器官膨大的分子機(jī)制,為根用菊苣高產(chǎn)育種奠定了理論基礎(chǔ)。